Sergiu Burduja a fost numit director interimar al Serviciului Vamal în 2019, fiind prezentat atunci angajaților instituției de către viceprim-ministrul Serghei Pușcuța.
Sergiu Burduja a deținut funcția de consilier al Ministrului Finanțelor și a fost șef al Direcției control financiar și audit din cadrul instituției.